Американские ученые из штата Мичиган полагают, что в качестве главной причины отравления вод Мирового океана ртутью являются бактерии.
Американским ученым удалось выяснить, как лягушкам удается продолжать жить даже после глубокой заморозки.
Биологи уже давно считают, что продолжительность жизни животного определяется очень просто: чем оно больше, тем дольше живет.
Ensembl (http://www.ensembl.org/) [54], гены со значением гипергеометрического скора более 3.0 считались значимо дифференциально экспрессирующимися. Анализ представленности Gene Ontology (http://www.geneontology.org/) [55] категорий в списке отобранных генов осуществлялся с помощью гипергеометрического теста. Категории с p-value меньше чем 0.01 считались значимо перепредставленными. Десять наиболее представленных категорий приведены в таблице 2
.
В список выявленных дифференциально экспрессирующихся генов входят ранее известные участники гомеостаза железа, такие как, TfR1, Dmt1, цитохром b редуктаза, ферропортин, Hfe, Cp, Hp, Slc11a2, Steap3, Slc25a37 (категории "iron ion transport", "response to iron ion" и " cellular iron ion homeostasis").
А также группы генов ранее не замеченных в регуляции гомеостаза железа, из которых следует отметить группу генов, участвующих в гомеостазе ионов меди, представленные в таблице 3
и участники липидного гомеостаза таблица 4
.
Таблица 2.
Список категорий Gene Ontology, наиболее представленных среди генов с измененной экспрессией.
Gene Ontology категория |
p-value |
cholesterol metabolic process |
4,54E-09 |
angiogenesis |
2,73E-05 |
lipid binding |
2,95E-05 |
electron carrier activity |
3,60E-05 |
lipid transport |
6,20E-05 |
phospholipid metabolic process |
1,30E-03 |
cellular copper ion homeostasis |
1,80E-03 |
cellular iron ion homeostasis |
2,40E-03 |
responce to iron ion |
2,70E-03 |
iron ion transport |
3,30E-03 |
Таблица 3.
Гены, регулирующие гомеостаз меди, экспрессия которых значимо коррелирует с уровнем железа в ткани.
Ген |
Название |
Mt1 |
metallothionein 1 |
Mt2 |
metallothionein 2 |
Atp7a |
ATPase, Cu++ transporting, alpha polypeptide |
App |
amyloid beta (A4) precursor protein |
Prnp |
prion protein |
Таблица 4.
Гены, регулирующие гомеостаз липидов, экспрессия которых значимо коррелирует с уровнем железа ткани
Ген |
Название |
Apol7a |
apolipoprotein L 7a |
Apoa5 |
apolipoprotein A-V |
Apoc3 |
apolipoprotein C-III |
Apoa1 |
apolipoprotein A-I |
Fabp4 |
fatty acid binding protein 4 |
Plcg1 |
phospholipase C, gamma 1 |
Acsl1 |
acyl-CoA synthetase long-chain family member 1 |
Srd5a1 |
steroid 5 alpha-reductase 1 |
Ppara |
peroxisome proliferator-activated receptor alpha |
Cyp39a1 |
cytochrome P450, family 39, subfamily A, polypeptide 1 |
Slc27a2 |
solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 2 |
Pnpla8 |
patatin-like phospholipase domain containing 8 |
Pemt |
phosphatidylethanolamine N-methyltransferase |
ALOX15 |
arachidonate 15-lipoxygenase |
GPAM |
glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial |
Смотрите также
Непрерывное культивирование микроорганизмов (хемостатный процесс)
Введение
Биотехнология - это наука, изучающая получение продуктов с
непосредственным участием биологических объектов, коими могут являться
организмы, органы, ткани животных или челове ...
Структурно-функциональное состояние организма человека
Введение
Человек - высшая непреходящая ценность на Земле. Писатели и
художники в своих произведениях во все времена раскрывали величие разума и
духовную красоту человека. Еще древние ...
Биогеографическое и биотическое районирование
1. Принципы биогеографического районирования
...